本校視光學系為全台灣第一所隸屬於醫學院體系內的視光學系，以醫學院為主體的教育體制下，將基礎科學、基礎醫學、臨床視光與跨領域教育加以整合，並落實創校理念，培育具馬偕博士奉獻精神之視光專業人才，提供學生「身、心、靈完整醫治」之全人醫學教育。

本校視光學系設立的理念及目標，主要是培育臨床實務、業界專長與基礎研究並重之視光專業人才，以提升視光及視覺生物醫學發展，期望成為國內最專業之視光領域、生物醫療產界與學術研究專才的搖籃。

本學系教學與課程設計以臨床視光學及實驗課程、基礎科學課程、基礎醫學課程為三大主軸，包含專業跨領域選修課程，例如醫材光學與人工智慧演算法等。此外，學系設有教學實驗室、臨床視光學實驗室、隱形眼鏡實驗室、配鏡製片實驗室、低視力評估暨輔具實驗室、視覺科學實驗室，提供學生完善的課程規劃及教學環境。

本系課程規劃以醫學院教學為方針，強調基礎學術與實務操作並重，使視光教學與產業緊密結合，全方位考量職場環境及產業脈絡，與國際視光學術界接軌，提供本學系學生優質的環境，培育具專業醫學素養之視光醫事人員。